Тоня Трайкова прави поетичния си дебют през 1985 година в издателство „Христо Г. Данов” с книгата „Участ”. През 1987 година публикува статията „Безсмъртието и смъртта в творчеството на Теодор Траянов” в сборника „Теодор Траянов, нови изследвания”, Издателство на БАН. Романът „Сакатите и светците” е отпечатан през 1992 година в издателска къща „Кронос”, а стихосбирката „Прашните контури на светлината” – през 1998 година в издателска къща „Христо Ботев”. Следват „Понякога поглеждам към небето” (Издателство „Дамян Яков”, 2003) и „Над болката” (библиотека „Орфеева лира”, 2008). През 2013 година издава в съавторство с Мари Байе романа „Наблюдателят на морето” в „Сосиете дез Екривен”.